Genes (Basel)：遗传性视网膜疾病相关遗传变异的鉴定！
2018-01-22 cuiguizhong MedSci原创
荷兰Radboud大学医学中心人类遗传学系和Radboud分子生命科学研究所的Astuti GDN近日在Genes (Basel)发表了一项重要的工作，他们在11名遗传性视网膜疾病患者中进行全外显子组测序，发现了12个独特的突变体，并对新的基因型-表型之间的相关性进行了研究。
荷兰Radboud大学医学中心人类遗传学系和Radboud分子生命科学研究所的Astuti GDN近日在Genes (Basel)发表了一项重要的工作，他们在11名遗传性视网膜疾病患者中进行全外显子组测序，发现了12个独特的突变体，并对新的基因型-表型之间的相关性进行了研究。
遗传性视网膜疾病（IRD）具有巨大的遗传异质性。最近，全外显子组测序（WES）发现了部分在IRD病例中发生突变的基因。因此，在同一候选基因中发现携带致病突变体的第二个病例或家族通常是具有挑战性的。在这项研究中，他们在孤立的IRD家族中寻找新的IRD基因相关的候选变异基因，并评估其因果关系，寻找新的基因型-表型之间的相关性。
在11名受IRD影响的确诊的患者中进行整个外显子组测序。有5例纯合性图谱数据可用于分析。与公共数据库进行对比，选择等位基因频率≤0.5％的变异体作为候选致病突变体。这些变异体的排列依据：（a）以前与IRD有关的基因； （b）Exome聚集联盟数据库（ExAC）中较低的等位基因频率； （c）结合CADD评分，进行电脑致病性评估；（d）与已知的IRD相关蛋白进行相互作用的蛋白。
他们在11个IRD确诊者中的11个不同基因中，发现了12个独特的突变体。在小核糖体亚基的核蛋白U5亚基200（SNRNP200）和锌指蛋白513（ZNF513）中分别发现了新的常染色体隐性和显性遗传模式。使用致病性评估系统，DEAH-Box Helicase 32（DHX32）中的一个突变体是与IRD相关性最高的新候选基因，随后是8个中等和更低的候选基因。在11个单个家族中鉴定的候选变异体与先前鉴定的IRD相关基因具有90％以上相同的缺陷。为了进一步鉴定同一基因突变的多个患者或家族，从而为其致病原因提供额外证据，需要全球数据的共享。
原文出处：
Astuti， G.D.N.， et al.， Identification of Inherited Retinal Disease-Associated Genetic Variants in 11 Candidate Genes. Genes (Basel)， 2018. 9(1).
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作者：cuiguizhong
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