几款科研作图软件
2014-09-06 邵斌 科学网
做生物科研的，免不了作图，日常工作中少不了做些网络图，这里向大家介绍几款相关软件。 1. pajek，比较小巧易用，功能和layout也算比较多。应该读作bayak，原意是蜘蛛的意思，一张典型的图如下所示这是一张讲生物网络鲁棒性的图，比较经典，已经是一本system biology书的封面2. cytoscape 全面强大，生物网络作图神器。layout丰富，可调选项众多，我用
做生物科研的，免不了作图，日常工作中少不了做些网络图，这里向大家介绍几款相关软件。
1. pajek，比较小巧易用，功能和layout也算比较多。应该读作bayak，原意是蜘蛛的意思，一张典型的图如下所示
这是一张讲生物网络鲁棒性的图，比较经典，已经是一本system biology书的封面
2. cytoscape 全面强大，生物网络作图神器。layout丰富，可调选项众多，我用的还是2.8.2 是比较老的一个版本，界面如下
3. cell designer 这个恐怕出了生物圈用的不多，主要画调控关系的。优点是生物元素比较清晰，不同蛋白都有不同形状，调控关系明确，缺点是比较像电路图，画多了容易乱。另有一个好处就是可以把调控网络直接转换为SBML文件！然后就可以去模拟了！
4. Graphviz 其实我对这个软件没太大爱好，需要装个java库，貌似做复杂网络的有人还是用的。
5 Word/Powerpoint，其实比大家想象的好用，我的第一篇文章的Fig1的网络就是拿word拖出来的，效果还不错。。。
作者：邵斌
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如何能进一步分解讲解更好。
140
有点难，再详细讲讲
146
汗 一个没用过！
132
太多的技巧了，要好好学习
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