Clin Chem：非编码RNA可作为肝癌的诊断和预后的生物标志物？
2019-07-20 gladiator MedSci原创
肝细胞癌(HCC)的诊断和预后迫切需要可靠的无创生物标志物。在此，我们不仅探索了小分子RNA (miRNAs)作为HCC生物标志物的潜力，还探索了其他类型的非编码RNA (ncRNAs)作为HCC生物标志物的潜力。 研究人员通过收集77例患者外周血标本，包括血浆无细胞RNA转录组57个，外体RNA转录组20个。在一个独立的验证队列(60-150个样本)中，使用逆转录(RT)-qPCR (qp
肝细胞癌(HCC)的诊断和预后迫切需要可靠的无创生物标志物。在此，我们不仅探索了小分子RNA (miRNAs)作为HCC生物标志物的潜力，还探索了其他类型的非编码RNA (ncRNAs)作为HCC生物标志物的潜力。
研究人员通过收集77例患者外周血标本，包括血浆无细胞RNA转录组57个，外体RNA转录组20个。在一个独立的验证队列(60-150个样本)中，使用逆转录(RT)-qPCR (qpcr)对显著上调的ncRNA和已发表的潜在HCC生物标志物进行了验证。特别研究了1个ncRNA biomarker,
RN7SL1及其S片段的诊断、预后表现及生物学功能。
研究发现某些循环的ncRNA可以通过与RNA结合蛋白结合而逃避RNA酶降解:在HCC患者中，有899个ncRNA高度上调。其中，337个基因为长片段非编码RNA, 252个基因为小核仁RNA, 134个基因为pi-RNA。选择48个候选基因进行RT-qPCR验证，其中RN7SL1、SNHG1、ZFAS1、LINC01359等16个ncRNA在HCC中显著上调。特别是RN7SL1 S片段的丰度可以区分阴性对照的HCC样本(曲线下面积为0.87;95%可信区间,0.817 - -0.920)。RN7SL1 S片段浓度较高的HCC患者生存率较低。此外，RN7SL1 S片段单独促进癌细胞增殖和克隆生长。
我们的研究结果表明，在血浆小RNA测序中发现了miRNA以外的多种ncRNA，这类RNA可作为非侵入性的生物标志物。特别是，我们发现srpRNA RN7SL1在HCC诊断和预后方面具有可靠的临床表现。
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作者：gladiator
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