Nat Commun：通过甲基化的变化来确定复发性淋巴瘤
2015-04-22 佚名 转化医学网
一队来自美国和意大利的研究人员开始通过标记复发患者体内DLBCL肿瘤来表征甲基化改变，发现最终可能有助于预测或治疗愈后复发的疾病形式的线索。他们在Nature Communications的报道说，研究人员选择来自11名患者诊断和复发过程中的DLBCL肿瘤的13例肿瘤组，通过亚硫酸氢钠测序来验证甲基化模式。 他们的研究结果显示，虽然在不同个体间诊断和复发肿瘤的甲基化区域的数量和类型是有差异的，但
一队来自美国和意大利的研究人员开始通过标记复发患者体内DLBCL肿瘤来表征甲基化改变，发现最终可能有助于预测或治疗愈后复发的疾病形式的线索。
他们在Nature Communications的报道说，研究人员选择来自11名患者诊断和复发过程中的DLBCL肿瘤的13例肿瘤组，通过亚硫酸氢钠测序来验证甲基化模式。
他们的研究结果显示，虽然在不同个体间诊断和复发肿瘤的甲基化区域的数量和类型是有差异的，但治疗后仍有明显的表观遗传学改变。
共同作者Giorgio Inghirami，一位来自威尔康奈尔医学院和都灵大学的研究人员，在一份声明中说：“化疗后的肿瘤与治疗前的肿瘤是不同的”，“这就是为什么原发性以及复发病变进行任何治疗前进行活检如此关键”。
Giorgio Inghirami和他的同事阐述，除了潜在的治疗意义，研究结果还表明在诊断时的甲基化分析也是有益的。在接下来的实验中，他们在那些诊断中未发现复发的患者中看到较少的不同肿瘤的甲基化。相反地，在那些诊断中继续复发的肿瘤患者中，甲基化异质性通常很高。
该研究的另一名共同作者Wayne Tam，来自威尔康奈尔医学院病理学和实验医学的研究员，在一份声明中说：“通过研究更多的样本，来达到诊断过程最终可以扫描一个病人的淋巴瘤表观基因组最丰富的地区，从而预测出治疗是否成功和肿瘤是否复发”。
在研究的第一阶段，研究人员使用亚硫酸氢钠测序的增强和降低来评估在3000000或4000000具有胞嘧啶邻近鸟嘌呤基因组的区域的甲基化水平，测试了11名化疗后且在治疗后六个月到13年之间复发的DLBCL患者的库活检标本。
不管是未进行治疗的诊断肿瘤还是从进行治疗和复发的身体的一个或多个站点所收集的肿瘤标本，匹配的标本均与每个个体匹配。
对每个诊断-复发肿瘤对的比较显示出每个样本在成千上万甚至超过1000000的区域的甲基化变化，包括复发时显示增强或更频繁或甲基化减少的区域。
而这些变化的性质和轨迹因病人而异，研究小组把复发相关的甲基化变化过度表示为包括转化生长因子-β或TGF-β的途径成分。
研究结果指出，虽然诊断肿瘤的异质性似乎预示着复发的风险，但在复发时，肿瘤内的甲基化异质性下降。研究人员发现来自那些继续肿瘤复发患者的原始标本比来自治疗后五年或以上未复发的七个人的标本显示出更高水平的肿瘤内甲基化异质性。
研究小组从来自另一个队列的59位具有DLBCL的患者身上，通过对样品有针对性的亚硫酸氢钠测序来验证了这种模式，进而强调了肿瘤诊断中相对统一的甲基化模式与存活率更长的无复发患者有关。
原始出处：
Heng Pan,Yanwen Jiang,Michela Boi,Fabrizio Tabbò,David Redmond, Kui Nie,Marco Ladetto,Annalisa Chiappella,Leandro Cerchietti,Rita Shaknovich,Ari M. Melnick,Giorgio G. Inghirami,Wayne Tam & Olivier Elemento.Epigenomic evolution in diffuse large B-cell lymphomas.Nature Communications, April 20, 2015; doi:10.1038/ncomms7921
作者：佚名
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