2023第六届世界帕金森大会：帕金森病-肠道宏基因组最新进展
2023-07-07 MedSci原创 MedSci原创
这些数据集将展示肠道宏基因组失调的程度和驱动因素，该研究的可重复性和信息含量将促进PD治疗和预防相关研究。
2023第六届世界帕金森大会于2023年7月4日至7日在西班牙巴塞罗那举行。通过世界帕金森病联盟，三年一度的世界帕金森大会为基础科学家、临床研究人员、医疗保健专业人员、帕金森病患者等提供了一个国际论坛，就最新的科学发现、医学和综合护理进行讨论、学习和辩论。
目前最新的假说认为，一些帕金森病（PD）病例可能从肠道开始并扩散到大脑。在最近的一项肠道宏基因组研究中，来自美国阿拉巴马大学伯明翰分校的学者报告了一个新入组的大型数据集，其中包括490名PD患者(PwP)和234名神经健康对照者(NHC)，使用深度测序进行分析。基于既往发现广泛的生态失调导致碳水化合物和SCFA代谢失衡，神经活性分子的合成和降解，神经毒物的过量产生，神经保护分子的消耗，以及机会性病原体的过量。在这里，研究人员提出了另一个独立的数据集，具有同样大的样本量(526 PwP, 316 NHC)和高分辨率的序列。
本研究研究由单一调查小组(NGRC)从头到尾采用标准方法进行。受试者在2014-2020年期间在美国的四个地点注册。从粪便中提取DNA并进行深度测序(50M reads/sample)。使用bioBakery处理序列，使用MaAsLin2、ANCOM-BC和SparCC进行分析。
结果显示，基于数据集1，本研究发现了84种PD升高或减少。在数据集2中，80%的pddp相关物种具有统计学显著性重复，6%有趋势，14%没有重复。多微生物集群网络，包括SCFA生产者，益生菌乳酸杆菌和双歧杆菌物种，以及条件致病菌被复制。此外，属内异质性被复制。微生物途径和基因的不平衡导致LPS、LPP和TMA的过量，以及SCFA、多巴胺、谷氨酸和烟酰胺的耗竭也被复制，但大肠杆菌、其免疫原和卷曲蛋白的增加没有复制。很明显，加倍N大大降低了噪声，简化了多微生物网络的结构和相关性，并使其更加清晰。从既往文献中的N~700个科目到汇总数据中的N~1500个科目，增加的信息量是可观的。
综上，本研究将展示两个前所未有的大数据和高分辨率数据集的结果，这些数据集将展示肠道宏基因组失调的程度和驱动因素，该研究的可重复性和信息含量将促进PD治疗和预防相关研究。
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