ARD：肺分子特征的综合分析揭示了系统性硬化症相关间质性肺病的关键驱动因素
2022-01-31 MedSci原创 MedSci原创
肺组织的综合转录组分析揭示了 SSc-ILD 中纤维化的关键特征。基于网络的贝叶斯方法提供了对适用于治疗 SSc-ILD 的关键调控基因和分子靶点的深入见解。
目的：肺纤维化，也称为间质性肺病(ILD)，发生在超过一半的系统性硬化症（SSc）患者中，并且是SSc 相关死亡率三分之一的死亡原因，目前尚无有效的治疗方式。该研究分析了系统性硬化症相关间质性肺病 (SSc-ILD) 的转录组数据，以评估与相关肺部疾病相关的显著分子和细胞特征，并确定疾病模块中的关键驱动基因和靶分子。
方法：来自 SSc-ILD (n=52)、特发性肺纤维化 (IPF) (n=549)、非特异性间质性肺炎 (n=49) 和肺动脉高压 (n=81) 和来自正常健康对照（n = 331）的差异表达基因被过滤、进行功能富集分析、基于网络的关键驱动分析和基于内核的扩散评分。在 SSc-ILD 患者中评估了富集的通路与临床参数之间的关联性。
结果：SSc-ILD 与其他纤维化肺部疾病具有共同的关键致病途径，但在某些病理过程中是可区分的。 SSc-ILD 在分子和细胞特征上与 IPF大致相似，但肌成纤维细胞的信号更强，在 SSc-ILD中肌成纤维细胞处于衰老和抗凋亡状态。 p53信号通路是SSc-ILD肺组织和肺成纤维细胞中最丰富的信号通路，与肺一氧化碳扩散能力、细胞衰老和凋亡显著相关。 EEF2、EFF2K、PHKG2、VCAM1、PRKACB、ITGA4、CDK1、CDK2、FN1 和 HDAC1 是疾病模块中具有高扩散评分的关键调节因子。
结论：肺组织的综合转录组分析揭示了 SSc-ILD 中纤维化的关键特征。基于网络的贝叶斯方法提供了对适用于治疗 SSc-ILD 的关键调控基因和分子靶点的深入见解。关键驱动基因在肺纤维化中起重要作用，能控制 SSc-ILD 的疾病模块，但它们都还不是当前治疗的直接靶点。
出处：
Jung SM, Park K, Kim K. Integrative analysis of lung molecular signatures reveals key drivers of systemic sclerosis-associated interstitial lung disease. Annals of the Rheumatic Diseases 2022;81:108-116.
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