PLos One:准确识别丙型肝炎病毒基因型的新方法!
2017-04-17 MedSci MedSci原创
近期,一项发表在杂志Plos One上的研究旨在通过cobas®HCV基因分型测定(GT)(Roche Molecular Diagnostics)与非结构蛋白5B(NS5B)测序相比较,评估HCV基因型/亚型1a和1b的正确分配。此项研究共收集了153例HCV基因分型患者的临床样本。在使用cobas®HCV GT进行基因分型后,使用NS5B基因中387bp片段的测序和系统分析来比较基因分型结果。
近期,一项发表在杂志Plos One上的研究旨在通过cobas®HCV基因分型测定(GT)(Roche Molecular Diagnostics)与非结构蛋白5B(NS5B)测序相比较,评估HCV基因型/亚型1a和1b的正确分配。
此项研究共收集了153例HCV基因分型患者的临床样本。在使用cobas®HCV GT进行基因分型后,使用NS5B基因中387bp片段的测序和系统分析来比较基因分型结果。主要差异定义为通过cobas®HCV GT和NS5B测序(包括基因型1亚型1a和1b错误分类)分配的基因型的差异。
此项研究结果显示:cobas®HCV GT和NS5B测序的总体一致性为98%;通过cobas®HCV GT鉴定的所有1a,1b,2,3和4基因型均与NS5B测序一致。通过cobas®HCV GT测定的“三个样品”进行了测定,并通过NS5B测序将其分为1a,3a和4d。
此项研究结果表明,cobas®HCV GT测定可以正确识别HCV基因型,并指出了基于DNA测序的其他方法对解决不确定结果的重要性。
原始出处:
Fernández-Caballero JA, Alvarez M, et al. The cobas® HCV GT is a new tool that accurately identifies Hepatitis C virus genotypes for clinical practice. PLoS One. 2017 Apr 14;12(4):e0175564. doi: 10.1371/journal.pone.0175564. eCollection 2017.
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