干货：这些软件你都不知道，还配做科研汪么？

2015-12-29 解螺旋.小米解螺旋，医生科研助手

师弟一向不务正业，整天吊儿郎当的，见不着人，今儿个破天荒出现在实验室，腆着脸问我：“师姐，给我推荐些工具呗，我到现在作图啊、设计引物啊，啥也不会。”逮着这么好的机会，我还不好好教训教训他：“你小子，天天干什么呢？一点基础的软件都不会，你还配做科研吗你？”。说归说，愿意学，总归还是个好的开始嘛。不过话说回来，科研狗也真不容易，不仅要英语好、数学好，还是半个平面设计师，各门各类的画图软件都得懂一点

师弟一向不务正业，整天吊儿郎当的，见不着人，今儿个破天荒出现在实验室，腆着脸问我：“师姐，给我推荐些工具呗，我到现在作图啊、设计引物啊，啥也不会。”逮着这么好的机会，我还不好好教训教训他：“你小子，天天干什么呢？一点基础的软件都不会，你还配做科研吗你？”。说归说，愿意学，总归还是个好的开始嘛。

不过话说回来，科研狗也真不容易，不仅要英语好、数学好，还是半个平面设计师，各门各类的画图软件都得懂一点，一个字累啊，为了避免小师弟一时半会消化不了，好不容易赞起来的积极性给吓退了，还是推荐一些最为基础吧。

引物设计软件

首先就是primer5了，主要是用来设计引物的，这个应该是分子生物学的最近本的了。另外就是Oligo，设计Fusion PCR和In-Fusion连接的引物的时候，比Primer premier直观一些。

质粒绘图软件

SimVector ，一款制作DNA分析和质粒图的工具。它可以绘制出失量质粒图并生成适用于出版的高质量的失量图形，执行限制性的生化酶分析，设计关于通路克隆，TA克隆和限制性克隆的实验。

凝胶分析软件

BandScan是一个很常用的凝胶图像分析软件，我们用它主要是为了分析蛋白表达量。

数学统计软件

Origin画各种各样的曲线图，兼做简单的数据处理；
SPSS ，大型的分析软件，几乎拥有所有的统计分析功能；

蛋白质互作网络分析软件

Cytoscape 是一款开源可视化软件，可用于整合模块化网络和生物科学联系网络图的绘制，专为生物研究设计。

文献管理软件

文献管理一般用EndNote就够了，除了管理文献，写文章的时候插入文献也是相当的方便；还有一个文献分析软件RefViz 2.1，，与EndNote结合使用，分析文献，可以省掉大把自己看自己归纳的时间。UltraEdit ，取代记事本的一个强大软件，很多时候会用到，比如把CNKI的数据导到EndNote，有些软件的16进制下的P-J。

图片处理及排版软件

图片处理最常用，相应的软件最多，不过有以下三个也就足够了。

第一位非PPT莫属！首先软件的普及性非常广，几乎是个电脑都会装有PPT（不用担心临时需要修改图片却找不到源文件处理时的软件）。其次，非常的简单易用（相信小伙伴们都深有体会），不得不说，PPT是一个伟大的创造！再者，修改很方便，直接点击需要修改的部件就可以进行一系列的修改了。但是它也有缺点。照片/图片插入/复制到PPT后，导出来的时候分辨率可能会有损失，要挽救分辨率，需要把PPT通过另存为PDF再转成图片（这时还可以设置分辨率）。

如果PPT 解决不了，那么就用Adobe Illustrator（AI）。AI是一款强大而且好用的图形设计、矢量图绘制软件，尽管图片编辑能力不如PS，但是在SCI图片处理中也绝对够用，而且操作要简单很多。新建页面的大小就是A4的大小，与大部分期刊发表的页面尺寸一致。整理完之后可以导出矢量图，一点都不用担心分辨率的损失。

再加一个补充的就是Photoshop，PS的强大在于对图片的编辑和修饰能力，图片排版也是编辑的一种。用PS的好处是你可以随意编辑图片，而且它支持很多种格式的图片。缺点就是，前面提到的功能太过于强大，所以比较复杂，使用起来不怎么方便。

作者：解螺旋.小米

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