Nat BME: 通过综合性磷酸化蛋白质组学分析来自各种来源的心肌纤维化中的信号扰动
2020-07-25 MedSci原创 MedSci原创
心血管疾病是一种全球流行病，每年导致全世界1770万人死亡，并且据预测，它仍然是发达国家死亡的主要原因之一
心血管病理发生和发展的分子机制可能是多方面的，并且很大程度上未知，这使治疗方向复杂化。 需要鉴定临床样品和心脏病理学实验模型在疾病过程中受到干扰的信号级联和分子过程，从而以改善慢性心血管疾病的早期发现，监测和管理。肥厚型心肌病（HCM）是最常见的遗传性心脏病。心肌纤维化是HCM的标志，被认为是导致快速性心律失常和心力衰竭发展的主要因素。纤维化通常在其他心血管疾病（例如缺血性和非缺血性心肌病）之后自然发生，其特征是心脏成纤维细胞过度增殖，肌成纤维细胞活化和纤维状细胞外基质（ECM）蛋白沉积增加。了解和靶向患者中干扰的信号传导级联至关重要。 要寻找新的诊断和治疗方式来对临床样品进行高通量分析外，测试和验证还将需要一种简单且具有代表性的心脏纤维化模型，以及可重现的方法来记录和分析由于病理发作或化学干预而发生的分子变化。
方法：使用磷酸化蛋白质组学分析作为统一的信息框架，我们对纤维化心脏组织的Biowire模型与来自HCM患者的心脏标本以及已建立的心脏肥大的横向主动脉缩窄（TAC）小鼠模型进行了比较，并分析和表征了信号扰动和纤维化。将所有受疾病影响的样本类型与匹配的非病理对照组织进行比较。这种系统的分析导致整个样本队列中数千种蛋白质，磷蛋白和磷酸化位点的鉴定和相对定量。此外，对于每组分析的实验，深度定量数据的生成使统计分析成为可能，揭示了数十种特定生物过程和信号传导途径，提供了有关心脏纤维化机制的进展和维持的潜在临床可行信息。病理。
结果：本研究涉及OOC模型系统以及动物和人类组织的磷酸化蛋白质组学分析，并概述了与患有HCM的患者的肌瘤切除术样本相关的磷酸化级联失调，以及最常用的心脏小鼠模型的最全面的磷酸化蛋白质组学分析 。
原文链接：
Kuzmanov, U., Wang, E.Y., Vanderlaan, R. et al. Mapping signalling perturbations in myocardial fibrosis via the integrative phosphoproteomic profiling of tissue from diverse sources. Nat Biomed Eng (2020). https://doi.org/10.1038/s41551-020-0585-y
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