PLoS Genet：全基因组测序显示食管腺癌与TLR通路基因非同义突变有关
2017-06-26 Emma MedSci原创
食管癌是常见的消化道肿瘤，全世界每年约有30万人死于食管癌。其发病率和死亡率差异很大。我国是世界上食管癌高发地区之一，每年平均病死约15万人。食管癌的发展也总是伴随着炎症和菌群紊乱。EAC（食管腺癌）是食管癌中仅次于食管鳞癌的一种癌，大部来自贲门，少数来自食管粘膜下腺体。
食管癌是常见的消化道肿瘤，全世界每年约有30万人死于食管癌。其发病率和死亡率差异很大。我国是世界上食管癌高发地区之一，每年平均病死约15万人。食管癌的发展也总是伴随着炎症和菌群紊乱。EAC（食管腺癌）是食管癌中仅次于食管鳞癌的一种癌，大部来自贲门，少数来自食管粘膜下腺体。
研究人员对171例EAC患者进行全基因组测序，在25/171（14.6％，PathScan p=8.7x10-5）肿瘤中发现非同义突变影响TLR通路，并且TLR突变病例更多的与近端肿瘤和转移性疾病相关，而只在相邻的巴雷特食管样本中发现了罕见突变。研究人员的发现在外EAC数据集和COSMIC数据库（10,318个样本）得到验证，在EAC数据集中33/149（22.1％，PathScan p = 0.05）肿瘤具有非同义TLR途径突变，在COSMIC数据库，子宫内膜样癌为188/320，58.8％，皮肤黑色素瘤为377/988，38.2％，大肠癌为402/1519，26.5％和胃腺癌为151/579，26.1％。其中TLR4是最常突变的基因，在10/171（5.8％）EAC肿瘤中有11个突变。TLR4突变体E439G、S570I、F703C和R787H对细菌脂多糖的反应性受损，荧光素酶报告基因测定显示信号传导被显著降低。
结果表明，TLR通路基因在EAC中反复突变，和TLR4突变对细菌脂多糖的反应降低。说明TLR途径的突变可能会破坏先天免疫信号传导，促进有利于肿瘤发生的微环境。
原始出处:
Fels Elliott, D. R., et al. Impact of mutations in Toll-like receptor pathway genes on esophageal carcinogenesis. PLoS Genet. 2017 May 22;13(5):e1006808.
doi: 10.1371/journal.pgen.1006808.
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作者：Emma
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