Circulation：单细胞RNA测序揭示器官特异性内皮细胞的不同特征
2020-11-11 星云 MedSci原创
内皮细胞（EC）根据其所在的血管和组织表现出较大的功能异质性。虽然这些功能差异可能被印在了转录组中，但维持EC异质性的通路和网络尚未完全明确。
内皮细胞（EC）根据其所在的血管和组织表现出较大的功能异质性。虽然这些功能差异可能被印在了转录组中，但维持EC异质性的通路和网络尚未完全明确。
为了研究EC特异性的转录组基础，Paik等分析了来自Tabra Muris集团的小鼠组织特异性EC的单细胞RNA测序数据。
12种器官内皮细胞的单细胞转录组
经分析发现，通过单细胞RNA测序和组织块RNA测序产生的组织特异性EC转录组数据之间有很强的相关性，验证了该方法的可靠性。采用基于GRAPH的聚类算法，研究人员发现某些组织特定的EC明显根据器官而聚类（如，肝、脑），而其他组织来源的EC的转录组有明显的重叠（如，脂肪、心）。
Lars2在雄性EC中特异性表达
此外，研究人员还明确了可能与维持其特征的组织特异性EC和信号通路的新型标记。性别是内皮细胞转录组中异质性的重要来源，研究人员发现Lars2基因在雄性小鼠EC中高度富集。小鼠心脏和肺EC的标志物在人类胎儿心脏和肺EC中保守。通过分析配体和受体表达模式，研究人员还确定了组织特异性EC和其他细胞类型之间潜在的血管分泌相互作用。
总之，Paik等人通过对单细胞RNA测序数据进行分析揭示了维持组织特异性EC特征的转录网络，并发现了组织特异性EC之间的血管分泌和功能性相互作用。
原始出处：
David T. Paik, et al. Single-Cell RNA Sequencing Unveils Unique Transcriptomic Signatures of Organ-Specific Endothelial Cells. Circulation. 2020;142:1848–1862
作者：星云
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